Dica de aplicativo para organização de disco rígido, HD externo, pen drive, ou qualquer outra unidade de armazenamento: Space Monger [1].
Para mim este software é comparável ao Google Maps do HD, com um clique você escaneia todo seu disco rígido e consegue dar zoom visualizando de arquivos grandes a arquivos pequenos.
Um exemplo do resultado do scan:

Veja que ele totaliza o conteúdo das pasta e quando você, consegui organizar meu HD externo, encontrando arquivos gigantescos que eu não utilizava pra nada, sistemas operacionais que estavam nas pastas erradas, etc.
Vale lembrar que é um software pago e com 30 dias grátis, que são mais do que suficientes para um uso caseiro. E apenas para o Windows.
[1] – http://www.sixty-five.cc/sm/